Die Stadt liegt an dem Kleinfluss Ahauser Aa im westlichen Münsterland nahe der Grenze zu den Niederlanden. Die maximale Nord-Süd-Ausdehnung des Stadtgebiets beträgt 18 Kilometer, die maximale West-Ost-Ausdehnung 14 Kilometer. Die höchste Erhebung liegt bei 70 Meter über NHN, der tiefste Punkt bei 36 Meter über NHN.
Die Stadt Ahaus liegt im westlichen Münsterland In angenehmer Nachbarschaft zu dem Steinfurter Land, den Baumbergen sowie der Hohen Mark. Nirgends sonst im Münsterland gibt es so viele Naturschutzgebiete wie hier. Feuchtwiesen, ausgetorfte Hochmoore und Heidelandschaften – Wittes Venn, Schwattes Gatt, Amtsvenn und Graeser Venn, Hündfelder Moor und Wacholderheide.
